伍连德(温兆伦 饰)和助手林家伟(刘华鑫 饰)前往监狱为沈家送行，监狱里空无一人，一问才得知，他们已经被提前押往京城。 日本人害怕姚仲亭(冯谦 饰)暴露他们所做的一系列阴谋，给他注射了鼠疫病毒。押送途中，姚仲亭寻机打死日本看守逃跑，病毒发作死在树林中。 防疫关键时刻，成败在此焚尸一举，仍然不见朝廷回复，伍连德心急如焚，决定孤注一掷，行驶总医官的权利下令焚尸。百姓闻讯包围坟场，阻止焚尸。为彻底消灭鼠疫，伍连德当众发誓，要把自己和百姓们亲人的尸体一起焚烧。他举起油桶浇在身上，此举，震动了所有在场的官员和百姓，大家一起跪下……大火熊熊，上万具尸体在火中焚烧…… 庆功宴中一道圣旨传来：滨州道台抓革命党不利，摘去顶戴花翎，傅家甸县令、警察局长慕德惠私放乱党重罪不赦，押送京城问斩。 除夕夜，疫情解除，百姓们燃放鞭炮庆祝节日，欢庆新生。将口罩抛向夜空……